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O Grupo de Ecologia de Vertebrados Terrestres atua nas duas reservas sob a gestão do IDSM, através do monitoramento da atividade de caça, realizado desde 2002 por uma rede de agentes coletores comunitários, e também, através do monitoramento da abundância de vertebrados terrestres, realizado através de censos diurnos em cinco sistemas de trilhas estabelecidos na área do lago Amanã, RDS Amanã. Estes monitoramentos estão implantados em quatro comunidades da RDS Mamirauá e quatro comunidades da RDS Amanã. Além dos estudos ecológicos voltados para as espécies alvo de caça, também são realizados estudos a respeito da ecologia da onça pintada, bem como estudos auto-ecológicos de primatas, como os do gênero Saimiri spp. E Cacajao spp.
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